Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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