Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms