Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms