Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms