Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hddc3Q9D114 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms