Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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