Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms