Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms