Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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