Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efcab2Q9CQ46 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms