Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms