Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms