Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms