Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

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Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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