Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LgsnQ8CIX8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LgsnQ8CIX8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LgsnQ8CIX8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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LgsnQ8CIX8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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LgsnQ8CIX8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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