Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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SbsnQ8CIT9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms