Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col6a6Q8C6K9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms