Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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