Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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