Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms