Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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