Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms