Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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