Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sema3cQ62181 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms