Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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