Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Syne3Q4FZC9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syne3Q4FZC9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms