Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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