Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pfdn4Q3UWL8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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