Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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