Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms