Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ulk3Q3U3Q1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ulk3Q3U3Q1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms