Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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