Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms