Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Rpusd2Q149F1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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