Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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Traf3ip1Q149C2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Traf3ip1Q149C2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Traf3ip1Q149C2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Traf3ip1Q149C2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Traf3ip1Q149C2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Traf3ip1Q149C2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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