Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms