Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms