Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms