Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms