Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pax5Q02650 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax5Q02650 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms