Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms