Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms