Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms