Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhodP97348 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhodP97348 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhodP97348 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhodP97348 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhodP97348 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms