Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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