Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms