Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cd38P56528 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms