Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms