Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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