Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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